Paso 1: Instalar VirtualBox y FreeSurfer (y convertir DICOM a NIFTI)
(Estas son las instrucciones para Windows. Si tienes Linux del Mac puede instalar FreeSurfer directamente siguiendo las instrucciones en la Página Web de FreeSurfer)
- Instalar VirtualBox para "Windows hosts x86/amd64" desde este enlace (~ 110 MB)
- Descargar y extraer la imagen de Virtualbox (Xubuntu) FreeSurfer desde aquí (~ 9 GB)
- Siga estas instrucciones para instalar FreeSurfer para VirtualBox. Recomiendo usar más memoria que usan (como 2 a 4GB).
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Si tienes archivos de MRI en DICOM se pueden convertir usando la herramienta de dcm2nii de MRIcron: win.zip
(Si ya están en formato NIFTI, entonces usted puede omitir este paso.)
- Expedirá los archivos y dcm2niigui.exe abierto
- Haga clic en "archivo -> DICOM a NIFTI"
- Seleccione la carpeta con los archivos DICOM dentro y haga clic en "abrir"
- El programa debe funcionar durante unos segundos
- Dentro de la carpeta DICOM ahora habrá uno o más. nii.gz archivos. Si está en duda sólo uso uno más grande. Le cambió el nombre a "brainscan.nii.gz" para que sea más fácil de encontrar y manejar.
También puede utilizar archivos DICOM directamente en FreeSurfer, pero por sencillez supongo que utilice archivos NIFTI.
(puede encontrar más información en dcm2nii aquí)
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