Simple - para equilibrar el color de tu flash con luz ambiente.
Al disparar con flash con iluminación incandescente el sujeto será a menudo demasiado azul y de fondo demasiado naranja. Un filtro de corrección (gel) hará que la luz del flash caliente para que coincida con la iluminación incandescente. También hay filtros disponibles para que coincida con la iluminación fluorescente (verde) y efectos especiales.
Excelente info se puede encontrar aquí: http://strobist.blogspot.com/2006/03/lighting-101-using-gels-to-correct.html
Algunos destellos vienen con filtros dedicados, algunas personas usan Velcro para colocar filtros en el flash. Voy a compartir mi forma de hacerlo.