En la investigación biológica, hay varias ocasiones en las que se necesitan comparaciones genéticas. Por ejemplo, hay veces cuando no hay mucha información en un organismo específico o una enzima que es de interés para el investigador. Por lo tanto es útil para poder encontrar similares genéticamente organismos o enzimas que son mejor investigadas. La genética puede ayudar a justificar el uso de estos organismos como base para la creación de un experimento o un fondo para un experimento. Además, la genética puede utilizarse para determinar las relaciones evolutivas entre organismos. Los organismos o enzimas genéticamente más similares son unos a otros y más recientemente que ramificó de un antepasado común. Por lo tanto es útil para familiarizarse con este tipo de software.
Centro Nacional para información biotecnológica (NCBI) es una base de datos donde, entre otras cosas, los genes pueden fácilmente ha buscado y encontrados. Básica Local herramienta alineación de la búsqueda (BLAST) es una herramienta en NCBI que permite la comparación de una secuencia de consulta con todas las otras secuencias en la base de datos.
Conceptos
El tema para este proyecto conocer personas con las herramientas y la base de datos es la enzima glutatión S-transferasa (GST) en Mus musculus (ratón de la casa). El ratón fue elegido porque su genoma ha sido ampliamente investigado y secuenciado. GSTs son enzimas que se han encontrado para ser parte de la protección de la célula de múltiples productos químicos peligrosos que se producen en el medio ambiente y dentro del organismo.
GSTs se dividen en tres superfamilias diferentes. El citosol es el más grande de estas superfamilias y esta superfamilia tiene trece clases reconocidas: alfa, delta, beta, epsilon, zeta, theta, mu, nu, pi, sigma, tau, phi y omega. Puede reconocer cada Superfamilia por la letra que sigue directamente Gst en la sección de nombre (es decir, la superfamilia alfa es Gsta) y luego cada Superfamilia tiene diferentes categorías debajo de ellos, que se distinguen por números.
Dominios conservados son secciones del genoma que son similares en varias especies. Esto sugiere que desempeñan una función importante para el organismo y por lo tanto ha sido preservada a través de la evolución.
Suministros
Computadora
Conexión a Internet
Sitios web
http://www.ncbi.nlm.nih.gov
http://Blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
Tiempo
Este proyecto no debe tomar más de 20 minutos.
