Una proteína la impresión 3D: modelado de una máquina Molecular (2 / 6 paso)

Paso 2: Instalar PyMOL


PyMOL es un programa libre y de código abierto modelado y visualización de moléculas pequeñas y proteínas. PyMOL tiene una comunidad activa y creciente, así como una parte importante del mercado en la literatura científica, lo que lo convierte en una herramienta perfecta para la creación y personalización de modelos moleculares. PyMOL le permite crear y visualizar modelos moleculares, de la tradicional bola y el palo la modelo que hace hincapié en átomos y enlaces a modelos que enfatizan el volumen y las superficies de relleno de espacio. Va imprimir un modelo de relleno de espacio en este instructable para dar una idea de lo que una proteína realmente parecería.

La Wiki de PyMOL tiene excelente documentación sobre cómo instalar PyMOL para todos los sistemas operativos modernos. El principal PyMOL web ha realizado la construye para Mac y Linux fácilmente disponible. Por suerte, no es necesario compilar tu propio Windows ejecutable desde el código fuente (aunque ciertamente puedes si quieres) - otros afortunadamente ya hecho y hecho público los resultados. Te voy a mostrar los pasos ilustrados aquí para una instalación de Windows, ya era el sistema operativo que utiliza.

Instalar PyMOL en Mac:
http://www.pymolwiki.org/index.php/MAC_Install

Instalar PyMOL en Linux:
http://www.pymolwiki.org/index.php/Linux_Install

Instalar PyMOL en Windows:
http://www.pymolwiki.org/index.php/Windows_Install

Brevemente e ilustrado:

  1. Siga el enlace dado en el paso 2 de la guía de instalación de Windows en el PyMOL Wiki.
  2. Descargar la versión correcta de PyMOL (puesto que el 2.7 Python he instalado previamente es de 64 bits, lo instalo el archivo de 64 bits de PyMOL, pymol-1.6.0.0.win-amd64-py2.7. exe).
  3. Una vez descargado el .exe PyMOL, ejecute al instalador. Use todos configuración de instalación predeterminada.
  4. Para poder ejecutar PyMOL, C:\Python27\PyMOL en su sistema de archivos y ejecute la aplicación PyMOL.exe. (Usted también puede crear un acceso directo del escritorio en este momento).

Ahora tiempo para encontrar algunas proteínas!

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